长沙海关技术中心拥有海关总署批准的国家级食品安全检测重点实验室、湖南省科技厅批准的食品安全科学技术湖南省重点实验室。实验室有博士9人、硕士24人、研究员8人、高级工程师26人。

实验室获中国国家认证认可监督管理委员会检验检测机构资质认定（CMA）、中国合格评定国家认可委员会实验室认可（CNAS），是湖南省农业厅考核通过的“农产品质量安全检测机构”，是印度尼西亚农业部认证的“输印尼食品农产品检测资质实验室”。实验室具有食品、农产品及相关产品的检测能力3600多项，涉及乳及乳制品、动物源性食品及其产品、植物源性食品及其产品等15类产品。

中心共承担国家级科研课题18项，省部级科研课题45项；主持获得国家科技进步二等奖2项，总署一级成果1项，省部级科技一等奖5项，省部级科技二等奖2项，制定国家标准62项、行业标准64项，在国际国内发表论文100多篇，获得国家发明专利14项。

中心关注食品安全，科普与宣传齐发展。通过科普进校园、科普进商场、实验室开放日、科普讲解比赛等系列活动，多途径开展科普宣教。

长沙海关技术中心走进商场，为学生和家长们讲解国门安全以及食品安全知识，引导学生和家长关注食品安全。

技术中心博士研究团队会同永州海关相关工作组开展输澳蔬菜农药残留监测比对项目采样工作，共在8个蔬菜基地采集了满足研究项目要求的样品共36个，其中蔬菜28个、土壤样品8个。

技术中心第一党支部邀请机场海关走近实验室，沉浸式体验检测全流程，并开展“走近食安”主题党日活动。

技术中心博士攻关团揭榜挂帅污水中毒品检测项目等。

怀化综合室联合怀化海关组织开展实验室开放日活动，邀请职工子女走进实验室，倾听食品安全科普课、参观食品检测实验室、操作食品科普小实验，真实感受食品安全在身边。